明治28（1895）年、平安遷都1100年祈年事業であった平安神宮造営と時を同じくして、大日本武徳会の演武場として武徳殿の建設計画が持ち上がります。 そして明治32（1899）年、故事にちなんで平安神宮の北西の地に武徳殿を竣工しました。 その後は武術教員養成所（後の武道専門学校）も開設され、「東の講道館、西の武徳殿」と評されるほど日本の武道の中心的存在となっていくのでした。

昭和50年代に入ると、音楽学部の移転計画が持ち上がり、武徳殿の行く末が案じられました。 これに対し、全日本剣道連盟・京都府剣道連盟は武徳殿保存を京都市に要請し、ついに武徳殿保存が決定されたのです。 昭和58（1983）年には、明治期の大規模木造建築・武道史における貴重な建造物である点が評価され、京都市指定有形文化財になりました。 更に平成8（1996）年には国の重要文化財指定を受け、建築物としても高く評価され今日に至っています。

このように、武徳殿は明治32年の落成以来、演武場・道場として、また多くの武道家の修練の場として、武道の殿堂という地位を保ちつづけているのです。

毎年５月２日より４日間にわたり「全日本剣道演武大会」（旧京都大会）が日本全国はもとより世界各地から錬士六段以上の3000人を超える剣士が１年間の修錬の成果を披露する演武大会として行われています。

京都府剣道連盟に所属する武道家一人一人がこの武道のメッカである武徳殿で常に稽古が出来る喜びと、誇りを持ち、いつまでもこの武徳殿を守っていく義務と責任を持たなければなりません。

平安京大内裏にあった建物のひとつに禁裏の道場がありました。 桓武天皇はこの道場で武技を奨励していたともいわれており、宮中で競馬や騎射などを展覧する場として利用されていました。 この平安時代の道場は大内裏の太極殿の北西、宴の松原に隣接したところに建てられていました。 そして現在の武徳殿も太極殿を模した平安神宮の北西に位置しています。 このような故事に倣いながら武道の振興・発展を願う思いが、武徳殿の建設に込められていたのです。

武道センターの南側にある武徳殿南門は、幕末期に京都の治安維持につとめた京都守護職の御用屋敷門でした。 御用屋敷は現在の京都府庁内にありましたが、大政奉還に伴い慶応3(1867)年12月に廃止されました。 その後御用屋敷は取り壊され、今は京都府庁内に石碑を残すのみとなっていますが、御用屋敷門はここ武徳殿の南へ移築されました。 この武徳殿南門は、京都守護職の往時の面影を偲ばせてくれるもののひとつとなっております。